비용편익분석에서는 '모든' 비용과 편익을 고려하므로 화폐적 비용이나 편익으로 쉽게 측정할 수 없는 무형적인 것도 포함됩니다. 다만 공공사업의 '무형의 비용 및 편익'은 측정이 어려운 경우가 많습니다.
반면 비용효과분석은 외부효과나 무형적·질적 가치의 분석에 더 적합하기 때문에 공공부문에 더 쉽게 적용되는 것입니다.
즉 비용편익분석에서는 쉽게 측정할 수는 없어도 무형적인 것도 포함해서 사회 총체적인 비용과 편익을 측정하지만, 무형성 때문에 평가가 힘든 경우에는 비용효과분석이 더 효과적일 수 있다는 것입니다.